El estado de Morelos posee varios museos a lo largo de su territorio, el de mayor importancia por la cantidad de obras que aloja y por el edificio mismo en el que está ubicado es el Museo Regional Cuauhnáhuac en el Palacio de Cortés, inaugurado hace más de treinta años, este museo nos narra la historia de nuestro estado, desde sus primeros pobladores hasta nuestros días.
Las dos luchas armadas más grandes de nuestro país, (la Independencia y la Revolución), son expuestas en los museos de la zona oriente, escenario estas gestas heróicas. Cuautla cuenta con el museo de San Diego y el Museo Casa Morelos; aquí se describe el histórico Sitio de Cuautla de 1812; en Jantetelco está el museo Casa de Matamoros, con objetos personales de este héroe de la independencia.
En Anenecuilco Morelos nació Emiliano Zapata, líder de la revolución en el Sur de México; Aquí está el Museo La Lucha por la Tierra, justo donde se ubica la casa donde nació el general, hoy este museo ha sido remodelado, cuenta con una excelente museografía.
Otros sitios también cuentan con pequeños museos dedicados a la revolución, entro otros están: El Museo Cuartel de Emiliano Zapata, en Tlaltizapán y el Museo de Sitio en la Hacienda de Chinameca, lugar donde fue asesinado.


Los museos de sitio de las zonas arqueológicas también nos llevan de la mano para adentrarnos en estas fascinantes culturas, entre ellos destaca el museo de sitio de Xochicalco con una arquitectura totalmente ecológica; las zonas arqueológicas de Coatetelco, Chalcatzingo y Chimalacatlán también cuentan con pequeños museos.
Existen otros recintos dedicados a la historia de nuestra entidad sostenidos principalmente por la propia comunidad y el apoyo de los ayuntamientos, tal es el caso de los museos de Tlaquiltenango, dedicado a la vida del luchador social Rubén Jaramillo, o el museo del campesino en Xochitepec.
En Tepoztlán, el ilustre poeta tabasqueño Carlos Pellicer donó su magnífica colección de arte prehispánico que está exhibida en el museo que hoy lleva su nombre.
Varios de los conventos del siglo XVI, también albergan pequeños museos, como en Tepoztlán, Tlayacapan y Oaxtepec.
En Cuernavaca, además del museo Cuauhnáhuac, existen: El Museo Robert Brady, con una extensa colección de arte de varias partes del mundo; el museo de El Castillito, con una colección de fotografía antigua de Cuernavaca; el museo de la herbolaria en el Olindo en Acapantzingo; el nuevo museo de ciencias en el Parque Ecológico de Acapantzingo y el museo de sitio del Jardín Borda con la historia del segundo imperio de México que tuvo su sede en este recinto.